هذا الكتاب من الكتب المهمة للعلامة ، يحوي ٦٦٠٠ فرع من الفروعات الفقهية ، آلفه بطلب من ولده فخر اللمحققين في ١٠ سنوات ، وعلى هذا الكتاب شروح كثيرة لكثير من العلماء ، مثل المحقق الكركي ، والشهيد الاول. والفاضل الهندي ، والسيد جواد العاملي ، وابن العلامة فخر المحققين.
١٨ ـ مختلف الشيعة في احكام الشريعة ، مطبوع.
١٩ ـ مدارك الاحكام ، مفقود.
٢٠ ـ المعتمد في الفقه ، مفقود.
٢١ ـ منتهى المطلب في تحقيق المذهب ، مطبوع.
٢٢ ـ المنهاج في مناسك الحاج ، مفقود.
٢٣ ـ نهاية الاحكام في معرفة الاحكام. مطبوع.
٢٤ ـ واجبات الحج واركانه. مخطوط.
١٥ ـ واجبات الوضوء والصلاة.
(و) الكلام :
١ ـ الابحات المفيدة في تحصيل العقيدة.
٢ ـ الاربعين في اصول الدين ، مفقود.
٣ ـ استقصاء النظر في البحث عن الفضاء والقدر ، مطبوع.
٤ ـ الاسرار الحنفية في العلوم العقلية ، مخطوط.
٥ ـ الباب الحادي عشر ، مطبوع مرارا.
٦ ـ الالفين الفارق بين الصدق والمين ، مطبوع مرارا.
٧ ـ تسليك النفس الى حظيرة القدس. مخطوط.
٨ ـ انوار الملكوت في شرح الياقوت.
٩ ـ التعليم التام في الحكمة والكلام ، مفقود.