منهجي في فهرس المكتبة :
وكان منهجي في فهرس المكتبة أن أذكر رقم النسخة ثمّ اسم المؤلِّف وتاريخ وفاته وموضوع الكتاب ، ثمّ التعريف بالكتاب بشكل موجز ، وكان معتمدي في تقديم المعلومات اللازمة عن كلّ من محتويات هذا الكتاب ثلاثة مصادر : الذريعة إلى تصانيف الشيعة ، والتراث العربيّ المخطوط ، وما يذكره مؤلّفو الكتب المخطوطة في مقدّماتهم ، مع مراعاة الأمانة العلميّة في النقل وعزو المعلومات إلى مصادرها ، أمّا ما لم يذكر في شيء من هذه المصادر الثلاثة فأحاول أن أضع له ترجمة معتمداً فيها على ما يُتاح من وسائل البحث والمعرفة ، ثمّ أذكر ما اشتملت عليه النسخة ومقدار نقصها وأوّلها وآخرها ، ثمّ التعريف بالنسخة كاملة وبالتفصيل ؛ من أجل التوثيق وتقديم فوائد أُخر غير خافية ، ثم نوع الغلاف ولونه وعدد أوراقها وقياسها.
بقي أن ألفت نظر الباحثين الكرام إلى بعض الأمور :
أوّلاً : إنّي رتّبت نسخ الفهرس بحسب حجم الكتب فابتدأت بالصغير وانتهيت بالكبير ، مع وضع الفهارس الفنّيّة في آخره خدمة للباحثين.
ثانياً : إنّي أشرت إلى كلّ نسخة ذكرها الشيخ آقا بزرك الطهرانيّ (ره) في كتابه الذريعة إلى تصانيف الشيعة وإلى كلّ كتاب لم يُذكر فيها ، وكذا كتابيه طبقات أعلام الشيعة وذيل كشف الظنون ؛ وذلك لأنّ هذه المكتبة كانت من مصادر كتبه الثلاثة هذه.