ويُنقل أنّ ولده السيّد محمّـد الإخباري قد أتلف بعض مؤلّفات والده الفلسفية لأنّها كانت تخالف مشرب الإبن الإخباري.
ومن ذرّيّتة سماحة آية الله السيّد عبّاس المدرّسي اليزدي أطال الله عمره ، وهو من أساتذة الحوزة العلمية في النجف الأشرف وقم المقدّسة.
وفاته :
توفّي السيّد صدر الدين في سنة ١١٥٤ هـ ، ودُفن في جوار مقبرة الآخوند الكرباسي في منطقة «جوي هرهر».
مؤلّفاته :
ترك السيّد آثاراً علمية في الفقه والمنطق والتفسير والدعاء ، منها :
١ ـ سلسبيل المسلسل بالدليل (في الفقه).
٢ ـ لئالي الليالي في تهجّد الليالي (فارسي).
٣ ـ مرصّع الحواشي (في المنطق).
٤ ـ حاشية على شرح اللمعة.
٥ ـ شرح الصحيفة السجّادية.
٦ ـ حاشية على مسالك الأفهام.
٧ ـ حاشية على مدارك الأحكام.
٨ ـ الحاشية العرفانية على تفسير البيضاوي.
٩ ـ عين الحقيقة (تفسير سورة التوحيد).
١٠ ـ لسان الصدق في تحقيق الحقّ (تفسير سورة الحمد).
١١ ـ جواهر الكلام في علم الكلام.