والعنوان المختار هو عنوان النسخة المعتمدة في التحقيق ( نسخة استانبول ) وعنوانها : « مشتبهات القرآن » فهو مختصر ومعبّر.
بدأ المؤلف كتابه بمقدمة ؛ أشار فيها إلى الدوافع التي حملته على التأليف ، وهي : المعونة على حفظ القرآن الكريم وتثبيته. وذكر الشيخ أنه استقصى مواضع المتشابه في القرآن كي يكون كتابه كافيا في هذا الباب ، ويغني عن غيره.
ثم بدأ المؤلف في ذكر أبواب الكتاب ، فيذكر عنوان الباب ثم يتناول مواضع المتشابه في القرآن بترتيب السور في المصحف ، ولم يخرج المصنف عن هذا الترتيب إلا قليلا ، وقد أشرت إلى ذلك في موضعه من التحقيق. وهذا الحصر الدقيق لمواضع المتشابه يشهد بتمكّن الإمام الكسائيّ في حفظ القرآن الكريم والإحاطة بمواضع المتشابه فيه.