الدراسات الإسلامية (اصول الدين والشريعة والقانون) ، وكلية الدراسات العربية ، وكلية المعاملات والإدارة ، وكلية الهندسة والصناعات ، وكلية الزراعة ، وكلية الطب ، وكلية التربية ، وذلك علاوة على كلية البنات الإسلامية والتي فتحت مجالا جديدا لدخول الفتيات إلى هذه الجامعة العتيدة.
وما أن صدر قانون تطوير الأزهر ، حتى بدىء في وضعه موضع التنفيذ.
وفي شهر مارس ١٩٦٤ وضع حجر الأساس لمباني الجامعة الجديدة في مدينة نصر. وقد تم افتتاح مباني بعض الكليات مثل كليات الهندسة ، والعلوم ، والإدارة والمعاملات ، والزراعة ، وكلية البنات ، ويجرى الآن العمل في إنهاء بقية مباني ومعامل هذه الكليات وتقدر تكاليف هذه المباني بحوالي ٠٠٠ ، ٥٠٠ ، ٢ جنيه مصري. وهي مصممة على أحدث الطرز وتضم مدرجات ومعامل حديثة.
وتقع كلية الطب في مستشفى الحسين الجامعي بجوار الجامع الازهر. وهي تضم حاليا ٥٠٠ طالب.