القسم الأوّل على نشأة مذهب الجعفرية وتطّوره. وأمّا القسم الثاني فيدور البحث فيه حول إمامة أهل البيت عليهم‌السلام ، وسبب التسمية بمذهب الجعفرية.

الباب الثالث : هو البحث عن مصدر التشريع عند مذهب الجعفرية ، ويتكوّن من قسمين : يدور البحث في القسم الأوّل حول القرآن وتاريخ جمعه وآراء علماء الشيعة فيه ، كما يشمل أيضاً ردّهم على دعوى تحريف القرآن الموجّهة إليهم. وأمّا القسم الثاني فيدور البحث فيه حول حديث رسول الله صلى‌الله‌عليه‌وآله‌وسلم ، وآراء الشيعة عن الصحابة ، والمكثرين في الرواية.

الباب الرابع : هو الاختتام ، ويحتوي على النتائج والاقتراحات.