كما قامت [دار المصطفى (ص) لإحياء التراث (قم ـ ايران)] بتحقيق عدة مخطوطات من بينها : الصحيفة الصادقية ، للشيخ أحمد آل طعان (طبع في قم سنة ١٤١٩ ه‍) ، وشرح تردّدات المختصر النافع ، للشيخ علي بن الشيخ ابراهيم القطيفي (طبع في قم سنة ١٤١٩ ه‍) ، وغيرها من المخطوطات.

الى جانب هذه الجهود المؤسساتية هناك جهود فردية ، نذكر على سبيل المثال ما قام به الشيخ عبد الله الخنيزي من جهد لتحقيق تراث اسرته العلمي خصوصا كتب ومخطوطات والده الإمام أبي الحسن الخنيزي.

فقد قام بالتحقيق والتعليق على كتاب «تراث لب الألباب في إبطال شبه أهل الكتاب» للحجة المقدس الشيخ علي آل عبد الجبار (١٢٠٠ ـ ١٢٨٧ ه‍) وقد طبع في بيروت سنة ١٤٠٨ م.

كما حقق وعلّق على كتاب «دلائل الأحكام في شرح شرائع الإسلام» [دورة فقهية] لوالده الشيخ علي أبو الحسن بن حسن الخنيزي (١٢٩١ ـ ١٣٦٣ ه‍) ، وطبعت بعض أجزائه المحققة في النجف الاشرف.

كذلك يمكن التنويه بالجهود المهمة التي قامت بها اسرة آل أبي خمسين في الأحساء ، وهي من الأسر العلمية المهمة ، لتحقيق تراث هذه الأسرة ، وقد تم تحقيق مجموعة من المخطوطات وإخراجها الى عالم الطباعة ، ومن بينها : تبصرة المهتدي والنص الجلي في إمامة أبي الحسن عليه‌السلام ، لآية الله الشيخ موسى بوخمسين (١٢٩٦ ـ ١٣٥٣ ه‍) ، تحقيق حفيده الشيخ حسن بن الشيخ باقر بوخمسين (طبع في بيروت سنة ١٤١٤ ه‍ ـ ١٩٩٤ م)

ومن الجهود الفردية أيضا ما قام به بعض رجال العلم بتحقيق بعض المخطوطات ، نذكر على سبيل المثال «بداية الهداية في التجويد» للشيخ عبد المحسن اللويمي المتوفى في حدود ١٢٥٠ ه‍ ، وقد حققه وعلق عليه الدكتور الشيخ عبد الهادي الفضلي وطبع في لبنان سنة ١٤٠٢ ه‍. و «ديوان شاعر الخليج الشيخ أبي البحر جعفر الخطي المتوفى عام ١٢٠٩ ه‍» قدم له وحققه وعلق عليه الأديب الشاعر عدنان السيد محمد