وفي سنة ١٣١٣ عين عضوا في ادارة الأزهر في مدة (مشيخة الشيخ البشري) ثم وكيلا للأزهر سنة ١٣٢٦ ه. وعين شيخا لمعهد الإسكندرية ومكث ٨ سنوات وأخيرا عين شيخا للأزهر في سنة ١٣٣٥ ه وأضيفت اليه مشيخة السادة المالكية سنة ١٣٣٦ ه.
وعاصر أحداث ١٩١٩ وكان علما بارزا واستطاع أن يقود السفينة في غمار هذه العواصف حتى لقى ربه سنة ١٣٤٦ ه.
وقد خطا بالأزهر خطوات نحو الاصلاح فقد أصدر قانون سنة ١٩٢٣ م.
بمقتضاه انقضت مدة الدراسة في كل المراحل إلى ٤ سنوات وانشىء (قسم التخصص) وكان رحمه الله واسع الاطلاع في العلوم الفقهية والفلسفية وتاريخ الإسلام.
ومن مصنفاته :
١ ـ إجازة للشيخ محمد بن محمد المراغي المالكي الجرجاوي.
٢ ـ الطراز الحديث في فن مصطلح الحديث.
٣ ـ تعليقات على شرح العضد.
٤ ـ كتاب تحقيقات شريفة.
* * *
الشيخ محمد بن مصطفى ابن محمد المراغي
ولد (بمراغة) من أعمال جرجا سنة ١٨٨١ م وكان والده عالما جليلا واسع الثقافة وظهرت نجابته فأرسله والده إلى الأزهر واتصل بالشيخ (محمد عبده) وتأثر بفكره وانتفع بمحاضراته في (البلاغة) (والتوحيد) (والتفسير).
وشجعه الشيخ محمد عبده على أن يعود للمصادر الأصيلة وألا يكتفي