وله من المؤلفات : الفوائد الرجالية المعروف برجال السيد بحر العلوم ، نشره حفيداه السيد محمد صادق بحر العلوم ، وابن أخيه السيد حسين بحر العلوم ضمن أربع مجلدات.
نال السيد بحر العلوم شهرة كبيرة بين زعماء عصره. وفي زمانه قسّمت المرجعيّة الدينيّة بين مجتهدي النجف فكان كلّ واحد منهم مختصّا بوظيفة محدّدة. وقد تصدى للفتيا الشيخ جعفر كاشف الغطاء ، وللتدريس بحر العلوم ، وللصلاة جماعة الشيخ حسين نجف ، وغيرهم لتنظيم الشؤون الادارية.
كما سعى السيد بحر العلوم ميدانيا لتعيين جملة من المراقد ، والتنقيب عنها.
أمّا مرقده بالنجف فهو يقع إلى جنب مرقد شيخ الطائفة الطوسي في مسجده الأثري الشامخ. وقد أسست مكتبة سمّيت مكتبة «العلمين» نسبة لهاتين الشخصيتين الكبيرتين في تاريخ الشيعة. وقد أوقف العلّامة السيد محمد صادق بحر العلوم مؤلفات مكتبته المخطوطة التي تناهز أربعمائة كتاب ، مع بعض مجاميعه التي لم تطبع ، لهذه المكتبة كما أخبرني بذلك. ولا أدري أين آلت بعده؟