٧ ـ استقصاء الاعتبار في تحرير معاني الأخبار.

٨ ـ استقصاء النظر في القضاء والقدر.

٩ ـ الأسرار الخفية في العلوم العقلية.

١٠ ـ الإشارات إلى معاني الإشارات.

١١ ـ الألفين الفارق بين الصدق والمين.

١٢ ـ أنوار الملكوت في شرح الياقوت.

١٣ ـ إيضاح الاشتباه في أسماء الرواة.

١٤ ـ إيضاح التلبيس من كلام الشيخ الرئيس.

١٥ ـ إيضاح مخالفة أهل السنة للكتاب والسنة.

١٦ ـ إيضاح المعضلات من شرح الإشارات.

١٧ ـ إيضاح المقاصد من حكمة عين القواعد.

١٨ ـ الباب الحادي عشر في أصول الدين.

١٩ ـ بسط الإشارات في شرح إشارات ابن سينا.

٢٠ ـ بسط الكافية اختصار شرح الكافية.

٢١ ـ تبصرة المتعلمين في أحكام الدين.

٢٢ ـ تحرير الأبحاث في معرفة العلوم الثلاث.

٢٣ ـ تحرير الفتاوي والأحكام.

٢٤ ـ تحصيل السداد في شرح واجب الاعتقاد.

٢٥ ـ تذكرة الفقهاء.

٢٦ ـ تسبيل الأذهان إلى معرفة أحكام الإيمان.

٢٧ ـ تسليك الأفهام في معرفة الأحكام.

٢٨ ـ تسليك النفس إلى حظيرة القدس.

٢٩ ـ التعليقة على كتاب أوائل المقالات للشيخ المفيد.

٣٠ ـ التعليقة على خلاف الشيخ.

٣١ ـ التعليقة على شرحه للتجريد.

٣٢ ـ التعليقة على عدة الشيخ.

٣٣ ـ التعليقة على المعارج.